Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc3P49135 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms