Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Epb41P48193 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Epb41P48193 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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