Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gli1P47806 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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