Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms