Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp9P41245 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp9P41245 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp9P41245 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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