Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms