Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms