Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms