Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SsbP32067 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SsbP32067 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SsbP32067 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SsbP32067 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SsbP32067 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SsbP32067 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SsbP32067 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms