Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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