Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms