Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx2P30658 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms