Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vcam1P29533 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms