Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms