Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kif5cP28738 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kif5cP28738 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms