Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms