Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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