Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms