Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms