Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms