Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms