Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcer1aP20489 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms