Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms