Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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