Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18529 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18529 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18529 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18529 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms