Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhoP15409 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhoP15409 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhoP15409 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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RhoP15409 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhoP15409 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RhoP15409 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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