Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrm1P12657 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrm1P12657 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrm1P12657 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms