Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PolP10400 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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