Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms