Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms