Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms