Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa5P09021 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms