Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TtrP07309 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TtrP07309 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TtrP07309 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TtrP07309 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TtrP07309 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TtrP07309 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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