Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GzmbP04187 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms