Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TcraP01849 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TcraP01849 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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