Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01649 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01649 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01649 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01649 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01649 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01649 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01649 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01649 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01649 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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