Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pak1O88643 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms