Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rdh7O88451 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rdh7O88451 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rdh7O88451 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh7O88451 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rdh7O88451 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh7O88451 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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