Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms