Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms