Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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