Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Copb2O55029 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms