Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlkO54988 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlkO54988 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlkO54988 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlkO54988 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlkO54988 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlkO54988 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms