Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffaO54786 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffaO54786 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms