Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Psmb10O35955 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Psmb10O35955 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Psmb10O35955 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb10O35955 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb10O35955 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Psmb10O35955 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms