Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stag2O35638 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms