Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms