Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smad6O35182 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smad6O35182 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smad6O35182 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms