Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms