Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms